Florian Robert
Doctorant en mathématiques appliquées et vision par ordinateur
À mon sujet
Après avoir obtenu l'agrégation de mathématiques en 2020, j'ai enseigné deux années en lycée et j'ai poursuivi ma formation avec le Master 2 Probabilités et Modèles Aléatoires de Sorbonne Université. Depuis le 1er octobre 2022, j'effectue mon doctorat intitulé : 'Impact de l’organisation interne des tissus tumoraux hépatiques sur l’efficacité de la thermothérapie par radiofréquence ou micro-ondes'.
Contact
Téléphone : +33 6 24 16 67 41
Email : florian.robert@math.u-bordeaux.fr
Bureau : 306 D
Adresse : IMB, Université de Bordeaux , Bâtiment A33, 351 Cours de la liberation, 33405 Talence Cedex, France
Téléphone : +33 6 24 16 67 41
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Bureau : 306 D
Adresse : IMB, Université de Bordeaux , Bâtiment A33, 351 Cours de la liberation, 33405 Talence Cedex, France
Ici, se trouve mon CV mis à jour.
Expériences de recherche
- J’ai effectué un stage de Master 2 au sein de l’équipe SISTM, sous la direction de Mélanie Prague. J’ai travaillé sur l’estimation de paramètres de modèles mécanistes via des études variationnelles sous Monolix et séquentielles par les filtres de Kalman. L’objectif premier de ce stage était de modéliser conjointement la charge virale et la réponse immunitaire face au virus SARS-CoV-2 dans un échantillon de 18 singes avec des profils différents (vaccination et infection antérieure). Le second objectif était de comparer l’approche variationnelle et l’approche séquentielle dans le cas de données parcimonieuses et d’équations différentielles ordinaires dites raides.
Pour plus de compléments : Mémoire - Diapos
- Depuis le 1er octobre 2022, je suis en thèse co-supervisée par Christophe Grosset et Baudouin Denis de Senneville. Ma thèse se concentre sur l’étude des paramètres bioarchitecturaux de tumeurs du foie. Pour cela, nous utilisons des stacks d’images de microscopie électronique à balayage en série (SBF-SEM) dont nous segmentons les différentes composantes (cellules, noyaux, mitochondries,…) avec des méthodes de deep learning. Nous analysons ensuite les différentes composantes de manière intra et inter tumorale afin de déterminer des marqueurs bioarchitecturaux permettant de mieux comprendre leur comportement.
Publications scientifiques
- Florian Robert, Alexia Calovoulos, Laurent Facq, Fanny Decoeur, Etienne Gontier, Christophe F. Grosset, Baudouin Denis de Senneville, “Enhancing cell instance segmentation in scanning electron microscopy images via a deep contour closing operator”, 2024. arXiv: 2407.15817.
Interventions scientifiques
- Forum technologique en microscopie électronique volumique (Oxford, Octobre 2024).
- Journées du Réseau Imageries en Microscopie Electronique (Bordeaux, Mai 2024), invité par le réseau
- Assises juridiques de la santé et des biotechnologies (Paris, Juin 2023), invité par l’agence Lexposia.
- MARGAUx PhD Days (Poitiers, Mai 2023).
Formations suivies au cours de mon doctorat
- Bien débuter avec Git (3h)
- Formation prévention et risque Néo (1.3h)
- Intégrité scientifique dans les métiers de la recherche (12h)
- Ethique de la recherche (12h)
- Python en Deep Learning (12h)
- Utiliser ssh de manière efficace et sécurisée (1h)
- Sensibilisation à l’impact environnemental du numérique (6h)
- Neural Network Speed-up and Compression (12h)