Activités

Projets

  • 2022-2023 - Porteuse du projet EVOMULTI: Rôle du métabolisme dans la transition EVOlutive vers la MULTIcellularité : approches expérimentales et modélisation mathématique.
    Financement : CNRS 80|Prime.
    Partenaires : Inria MONC, Institut de Biochimie et de Génétique Cellulaires (Bordeaux).

Thèse et Post-doctorat

  • Depuis Décembre 2022 - Post-doctorat de Giorgia Ciavolella: Modélisation Mathématique et assimilation de données pour la dynamique de cellules tumorales circulantes dans la circulation sanguine.
    Co-encadrement : Annabelle Collin.

  • Depuis Octobre 2022 - Thèse de doctorat de Julien Granet: Modélisation mathématique de la stabilisation évolutive de la multicellularité chez la levure.
    Co-encadrement : Bertrand Daignan-Fornier (IBGC), Clair Poignard.

  • 2018 - Projet CEMRACS: Étude de l’effet de l’environnement sur la dynamique cellulaire.
    Formation : thèse de Mathématiques Appliquées. Étudiants : Alessandro Cucchi & Lamis Sabbagh.
    Co-encadrement : Nicolas Meunier & Laurent Navoret.

Stages et projets en Licence et Master

  • 2023 - Stage de M2 - Camilla Paleari: Deep-learning analysis of Flow Cytometry Data for the early diagnosis of Acute Myeloid Leukemia.
    Background : M2 Computational science and Computational learning, Politecnico di Milano.
    Duration : 4 months. Cosupervision : Baudouin Denis de Senneville, Nicolas Papadakis, Clair Poignard.

  • 2023 - Projet Interdisciplinaire - Léa Alexandre, Axelle Davoust et Oriol Gomez Lores Formation : M2 Cancer Biology.
    Durée : 6 semaines.
    Co-encadrement : Vanja Sisirak (ImmunoConcept).

  • 2022 - Stage de M2 - Julien Granet: Modélisation Mathématique et Assimilation de Données pour la dynamique d’une Cellule Tumorale Circulante dans le sang.
    Formation : M2 Modélisation Numérique, université de Bordeaux.
    Durée : 6 mois. Co-encadrement : Annabelle Collin.

  • 2022 - Stage de M1 - Léa Comin: Analyse de données de cytométrie en flux pour le diagnostic de Leucémie Aigüe Myéloblastique.
    Formation : M1 Computational and Mathematical Biology, université Aix-Marseille.
    Durée : 12 semaines. Co-encadrement : Clair Poignard, Baudouin Denis de Senneville, Olivier Saut.

  • 2022 - TER et stage de M1 - Julien Hermant: Migration cellulaire : modélisation et comparaison à des données expérimentales.
    Formation : M1 Modélisation Stochastique et Statistiques, université de Bordeaux.
    Durée : TER + 7 semaines.

  • 2022 - Projet Interdisciplinaire de M2 - Mathilde Madéry and Hortense Perdrieau: Implication of dendritic cells in the induction of an anti-tumoral response in the context of immunotherapies.
    Formation : M2 Cancer Biology.
    Durée : 6 semaines.
    Co-encadrement : Vanja Sisirak (ImmunoConcept).

  • 2021 - Projet Interdisciplinaire de M2 - Inaara Kassamaly, Sonia Quertinmont et Julia Rossi: Cancer du pancréas : approches expérimentales et de modélisation pour évaluer le potentiel thérapeutique du vaccin à base de CD.
    Formation : M2 Cancer Biology.
    Durée : 6 semaines.
    Co-encadrant : Vanja Sisirak (ImmunoConcept).

  • 2021 - Stage de 2A - François Sorre: Numerical simulations of an active particle in a Stokes fluid.
    Formation : 2A Bordeaux INP.
    Durée : 2 mois.
    Co-encadrant : Clair Poignard.

  • 2021 - Stage de L3 - Manon Charmasson: Modeling the intracellular actin dynamics in quiescent cells.
    Formation : L3 Maths La Rochelle.
    Durée : 6 semaines.
    Co-encadrants : Clair Poignard, Olivier Saut.

  • 2021 - Stage de L3 - Pierre Charitat: Modeling the Snowflake Yeasts dynamics.
    Formation : L3 ENS Maths.
    Durée : 6 semaines.
    Co-encadrant : Clair Poignard.

  • 2020 - Projet Interdisciplinaire de M2 - Thomas Boyer et Chloé Porcheron: Fonctions des Cellules Dendritiques dans l’immunotherapie du cancer du sein : approches expérimentale et de modélisation.
    Formation : M2 Cancer Biology.
    Durée : 6 semaines (comme projet).
    Co-encadrant : Vanja Sisirak (ImmunoConcept).

  • 2020 - Stage de Robin Hanriot (prépa INP 2A): Modélisation de la dynamique d’adhésion d’une Cellule Tumorale Circulante à la paroi vasculaire : analyse de sensibilité des paramètres.
    Formation : prépa Bordeaux INP 2ème année.
    Durée : 6 semaines.
    Co-encadrante : Annabelle Collin.

Jurys et comité de suivi de thèses

  • 2022 - Examinatrice de la thèse de Coralie Picoche, Modélisation à fine échelle de la dynamique des communautés phytoplanctoniques, soutenue le 14/09/2022.

  • 2022 - Membre d’un Comité de Sélection de concours MCF, LJLL.

  • 2021 - Membre invité au jury de thèse d’Alessandro Cucchi, Études mathématique et numérique de modèles de migration cellulaire, soutenue le 06/07/2021.

  • 2021 - Membre du jury du concours Inria CRCN/ISFP, Inria Bordeaux Sud-Ouest.

  • 2019-2022 : Comité de suivi de thèse de Giulia Sambataro.

  • 2019 - Membre invité au jury de thèse de Cynthia Perier, Analyse quantitative des données de routine clinique pour le pronostic précoce en oncologie, soutenue le 14/11/2019.

Autres responsabilités

  • Relectrice pour les revues Acta Applicandae Mathematicae, ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, TCRT, RSOS, PLOS Computational Biology, Bulletin of Sociological Methodology.
  • Depuis 2021 - Rapporteuse pour l’ANR, CE45 - Interfaces : mathématiques, sciences du numérique – biologie, santé ; Phase 2 (4 projets).
Actuelles
  • 2022-Présent : Membre du Conseil de Laboratoire, IMB.
  • 2022-Présent : Co-responsable du groupe de travail local parité-égalité du centre Inria de l’université de Bordeaux avec Suzane Fleury, Clémence Frioux, Laercio Lima Pilla.
  • 2021- Présent : correspondante locale du GdR MATHSAV.
  • 2021-Présent : Co-responsable de la mission parité de la Fédération MARGAUx, avec Tristan Vaccon.
  • 2020-Présent : Chargée de mission parité à l’IMB.
Passées

  • 2020-2023 : Co-responsable du séminaire CSM avec Tommaso Taddei, puis Martin Parisot.

  • Durant la thèse
    Représentante des doctorants au conseil du laboratoire LMO, Orsay, 2015-2016.
    Représentante des doctorants au conseil de l’École Doctorale Mathématique de la région Paris-Sud, 2013-2015.
    Co-organisatrice du séminaire des doctorants du MAP5, avec Charlotte Dion, Gwenaelle Mabon, Jean Rochet, 2013-2015.

Diffusion scientifique

Je participe à l’initiative “1 scientifique, 1 classe, Chiche!"", qui vise à rencontrer les élèves de Seconde au lycée.

  • 2023

  • Conférence lors de la Semaine des maths, à destination des scolaires.

  • Portrait vidéo “Une minute avec…", Inria.

  • 2022

  • Interventions Chiche! (3), Lycée Maurice Ravel (St Jean de Luz) ; Lycée de Navarre (St Jean Pied de Port).

  • Intervention en collège via Femmes & Sciences, Collège de Lesparre-Médoc.

  • Conférence envers les lycéennes stagiaires de Moi Informaticienne, Moi Mathématicienne, IMB.

  • Portrait vidéo pour le grand public, France 3 Bordeaux Métropole.

  • Conférence Midis Maths, à destination d'élèves de Licence, IMB.

  • 2021

  • Fête de la science, Circuit Scientifique Bordelais : animation d’interventions Chiche! (2), Lycée Les Iris de Lormont.

  • Interventions Chiche! (4), Lycée Le Beau Rameau (Igon-visioconférence) ; Lycée de Borda (Dax).

  • Journée de l’IREM, Exposé à destination des enseignant·es en lycée, IMB.

  • 2020 - Fête de la science, Circuit Scientifique Bordelais : animation d’interventions Chiche! (4), Lycée de Nontron.

  • 2019 - Fête de la science, Circuit Scientifique Bordelais : animation d’ateliers d’initiation à la pensée informatique, Inria Bordeaux Sud-Ouest.

  • 2018 - La Science taille XX Elles, Science in the city (speed-meeting), Toulouse.

  • 2015 - Fête de la science Raconte-moi ta thèse! (Speed-meeting), Paris.