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Calcul et Développement

Pour vos questions relatives aux moyens de calcul/stockage et au développement,
venez nous rencontrer au bureau 270 ! (Laurent et Philippe)
venez discuter avec nous sur le Chat MCD Mattermost

Vous trouverez ici une présentation du pôle MCD pour les nouveaux arrivants.

[bleu]* Divers moyens de calculs sont accessibles aux membres de l’IMB[/bleu]

Par ordre croissant de complexité d’utilisation et de puissance :

votre poste de travail (portable ou diskless) !
bureau et compute-1To (local) : serveurs strictement identiques aux diskless (compte IMB)
PlaFRIM (IMB/LaBRI/INRIA) : cluster HPC avec gestionnaire de job (Slurm)
(inscription - en 3 étapes : 1-demande (via web) 2-acces web ([rouge]email n°1[/rouge] avec les information d’accès) 3-acces plateforme ([rouge]email n°2[/rouge] avec instructions d’accès) )) (générer votre clef SSH)(assistance)
MCIA (mésocentre/régional) : cluster HPC avec gestionnaire de job (Slurm/Torque) + solution de stockage pérenne iRODS
(procédure d’inscription - choisir l’Unité "IMB" pour pouvoir accéder aux ressources réservées) ⚠️ il faut demander tous les ans la prolongation de votre compte suite à un email intitulé [MCIA] your account will expire soon⚠️
GENCI (national) : cluster HPC avec gestionnaires de jobs / sur dossier
EGI (européen) : Grille de calcul Européenne. utilisation particulière

[vert]-> Des formations pour utiliser ces moyens de calculs sont disponibles sur la page[/vert] Formations

[bleu]* Divers moyens de développement sont accessibles aux membres de l’IMB[/bleu]

les moyens de Mathrice (créer un compte : cliquez ici puis sur connexion , aide)
- forge logicielle Gitlab : https://plmlab.math.cnrs.fr avec intégration continue, poiur héberger vos projets
- autres services :
  - https://services.math.cnrs.fr
  - https://portail.math.cnrs.fr/all-services
selon votre établissements d’origine et vos projets
- les moyens Inria :
  - forge logicielle : https://gitlab.inria.fr

[vert]-> Des formations pour utiliser ces moyens de développement sont disponibles sur la page[/vert] Formations

[bleu]* Ci-dessous, diverses documentations spécifiques pour les membres de l’IMB : [/bleu]

Les logiciels scientifiques

PlaFRIM - Se connecter

PlaFRIM3 - Utilisation (introduction)

PlaFRIM3 - visualisation déportée (ex : matlab)

Exécuter une commande graphique sur PlaFRIM3 et obtenir l’affichage sur son poste au bureau ou à la maison sans que le déport graphique de soit trop lent.

PlaFRIM3 - avancé : partie pratique

PlaFRIM3 - Divers

Comment installer des logiciels depuis un environnement non ouvert sur Internet

Comment mettre en place un tunnel http/https via votre connexion SSH
pour pouvoir installer des logiciels dans un environnement qui n’est
pas ouvert sur internet.
(vérifiez que la charte du système distant vous autorise à faire cela)

MCIA - Calculer au mésocentre régional (curta)

MCIA - Stockage de données volumineuses - iRODS

– Le système iRODS mis en place au sein du mésocentre Aquitain MCIA permet aux usagers de l’IMB de stocker de gros volumes de données de recherche (plusieurs To par utilisateurs).